019年3月19日 訊 /生物谷BIOON/ --在研究克羅恩病（一種胃腸道炎癥性疾?。┑念I(lǐng)域，一個重要的問題是如何將其致病原因與該病癥中固有的全身性炎癥反應(yīng)分開。對此，醫(yī)學(xué)博士Subra Kugathasan領(lǐng)導(dǎo)的研究人員最近發(fā)表了一項(xiàng)分析，研究了炎癥跡象，以評估可能的原因。
Kugathasan實(shí)驗(yàn)室的研究生Hari Somineni與埃默里和喬治亞理工學(xué)院的遺傳學(xué)家合作，采用了一種復(fù)雜的方法進(jìn)行探究。結(jié)果發(fā)表在《Gastroenterology》雜志上。
該小組研究了患有克羅恩病的兒科患者血液樣本中的DNA甲基化情況，包括診斷和治療后及隨訪。這些信息來自164名患有克羅恩病的兒童和74名對照的血液樣本。
“我們的研究強(qiáng)調(diào)了進(jìn)行縱向剖析，觀察治療前后患者的重要性，而不是僅僅采取橫斷面，”Somineni說。
DNA甲基化是一個動態(tài)過程，可以通過打開或關(guān)閉基因來影響復(fù)雜疾病的分子表型。研究人員觀察到，兒童克羅恩病患者在診斷時破壞的甲基化模式在治療炎癥后恢復(fù)到類似對照組。
Kugathasan是馬庫斯亞特蘭大埃默里大學(xué)醫(yī)學(xué)院和兒童保健學(xué)院的兒科和人類遺傳學(xué)教授，也是兒童移植和免疫介導(dǎo)疾病中心的主任。 Somineni是遺傳學(xué)和分子生物學(xué)系的研究生。
作者寫道，血液中絕大多數(shù)與疾病相關(guān)的甲基化變化“是炎癥的短暫后果，因而是疾病的結(jié)果”。 “我們所看到的是炎癥特征的治療可能從根本上治療克羅恩病的癥狀，而不是原因。”他們補(bǔ)充說：“這可能至少部分解釋了為什么克羅恩病通常仍然是終身緩解和復(fù)發(fā)疾病，盡管治療炎癥癥狀。”
由于樣本來自患者的血液，而不是他們的腸子。因此，白細(xì)胞中的基因主要提供有關(guān)全身性炎癥水平的信息是有道理的，這些信息在成功治療后會降低。 Somineni說，從腸道組織或位于腸道的免疫細(xì)胞中取樣可能會產(chǎn)生不同的結(jié)果。
研究人員采用“孟德爾隨機(jī)化”分析方法，以描繪可能導(dǎo)致疾病或由疾病引起的甲基化變化。這使他們能夠消除炎癥，揭示可能成為疾病發(fā)展的甲基化變化;這些甲基化變化似乎介導(dǎo)已知非編碼變體（單核苷酸多態(tài)性或SNP）的遺傳風(fēng)險。將甲基化數(shù)據(jù)與現(xiàn)有遺傳信息整合已經(jīng)指出了編碼核糖體蛋白S6激酶A2的基因RPS6KA2 - 一個Somineni計劃進(jìn)一步研究的基因。
資訊出處：Sifting through signs of inflammation to analyze causes of Crohn's disease
原始出處：Hari K. Somineni et al. Blood-derived DNA Methylation Signatures of Crohn's Disease and Severity of Intestinal Inflammation, Gastroenterology (2019). DOI: 10.1053/j.gastro.2019.01.270
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